Suomen ympäristökeskuksessa tehdään paljon vesiin ja meriin liittyvää mallinnusta. Osa malleista on kehitetty erityisesti palvelemaan vesien- ja merenhoidon tai merialuesuunnittelun tarpeita, osaa käytetään lähinnä tieteellisessä tutkimuksessa. Moni malli on kuitenkin käytössä sekä tutkimuksessa että päätöksen teon tukena.
Suomen ympäristökeskus tarjoaa myös vesiin ja mereen liittyviä mallinnuspalveluita.